Symbiose zwischen Pflanzen und Pilzen. Hyphen dringen nur in die Wurzelrinde ein, nicht jedoch in die Zellen. Diese Symbiose wird als mutualistisch bezeichnet, es findet ein Tauschhandel statt von welchem beide Partner profitieren. Zwischen Endo- und Ektomykorrhiza gibt es fliessende Übergänge, deshalb spricht man auch von Endo-Ektomykorrhiza.